More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3352 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3352  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
348 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.446334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3147  Ppx/GppA phosphatase  90.13 
 
 
329 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.75368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18070  Ppx/GppA phosphatase  63.26 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8357  Ppx/GppA phosphatase  56.82 
 
 
309 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2012  Ppx/GppA phosphatase  55.05 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0472  Ppx/GppA phosphatase  55.84 
 
 
311 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3146  exopolyphosphatase, putative  52.77 
 
 
310 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236338  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10505  hypothetical protein  53.92 
 
 
344 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0443339  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0609  Ppx/GppA phosphatase  54.4 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91513  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0999  Ppx/GppA phosphatase  52.13 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6144  Ppx/GppA phosphatase  53.65 
 
 
322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  52.94 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  52.94 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  52.94 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24540  Ppx/GppA phosphatase  52.23 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0079  Ppx/GppA phosphatase  52.29 
 
 
343 aa  305  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0656  Ppx/GppA phosphatase  51.48 
 
 
319 aa  305  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6748  Ppx/GppA phosphatase  52.61 
 
 
339 aa  298  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.740165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0833  Ppx/GppA phosphatase  50.98 
 
 
355 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0398772  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02700  exopolyphosphatase  50.33 
 
 
323 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0475  Ppx/GppA phosphatase  49.84 
 
 
311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0339  Ppx/GppA phosphatase  52.72 
 
 
314 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0406  Ppx/GppA phosphatase  52.88 
 
 
314 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1920  exopolyphosphatase  44.12 
 
 
322 aa  261  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3233  Ppx/GppA phosphatase  48.87 
 
 
308 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4595  Ppx/GppA phosphatase  47.27 
 
 
320 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27230  exopolyphosphatase  38.69 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104101  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5094  Ppx/GppA phosphatase  40.07 
 
 
304 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 
570 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  32.03 
 
 
534 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  29.58 
 
 
550 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  30.34 
 
 
549 aa  132  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  28.75 
 
 
539 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  27.78 
 
 
545 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  27.78 
 
 
545 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  29.97 
 
 
550 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 
544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  27.67 
 
 
514 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
557 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 
307 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  25.75 
 
 
544 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  27.19 
 
 
521 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  25.75 
 
 
544 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  27 
 
 
531 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  24.01 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.26 
 
 
545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  29.37 
 
 
549 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.04 
 
 
532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  26.32 
 
 
531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  27.59 
 
 
519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  29.02 
 
 
548 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  26.46 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  26.32 
 
 
531 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  25.99 
 
 
531 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  27.02 
 
 
553 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  26.16 
 
 
519 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  25.79 
 
 
527 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  30.16 
 
 
310 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  24.2 
 
 
521 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  27.01 
 
 
311 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  23.89 
 
 
519 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  23.99 
 
 
321 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  29.64 
 
 
524 aa  103  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  26.69 
 
 
312 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  25.66 
 
 
513 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  27.92 
 
 
502 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  31.82 
 
 
319 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  32.05 
 
 
304 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  24.84 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 
312 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  25.55 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  25.74 
 
 
523 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  26.3 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  27.01 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  25.57 
 
 
301 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27.46 
 
 
505 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  23.7 
 
 
510 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  25.99 
 
 
511 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  24.35 
 
 
312 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  27.1 
 
 
501 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  23.28 
 
 
306 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  26.32 
 
 
510 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  27.9 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.41 
 
 
513 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
305 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  24.28 
 
 
317 aa  89.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  25.32 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  24.44 
 
 
507 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  28.33 
 
 
305 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  27.65 
 
 
311 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0658  Ppx/GppA phosphatase  29.67 
 
 
305 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  24.34 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  27.52 
 
 
375 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  27.6 
 
 
524 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  27.16 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  32.59 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  30.41 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  25.25 
 
 
505 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>