More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6748 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6748  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
339 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.740165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02700  exopolyphosphatase  69.38 
 
 
323 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10505  hypothetical protein  67.65 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0443339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  64.85 
 
 
359 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  64.85 
 
 
359 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  64.85 
 
 
359 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0079  Ppx/GppA phosphatase  61.9 
 
 
343 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0999  Ppx/GppA phosphatase  67.21 
 
 
324 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0833  Ppx/GppA phosphatase  65.36 
 
 
355 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0398772  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0656  Ppx/GppA phosphatase  62.42 
 
 
319 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0339  Ppx/GppA phosphatase  67.2 
 
 
314 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0406  Ppx/GppA phosphatase  66.24 
 
 
314 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4595  Ppx/GppA phosphatase  63.34 
 
 
320 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0475  Ppx/GppA phosphatase  59.28 
 
 
311 aa  328  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2012  Ppx/GppA phosphatase  57.93 
 
 
311 aa  316  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0472  Ppx/GppA phosphatase  56.86 
 
 
311 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8357  Ppx/GppA phosphatase  56.07 
 
 
309 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3146  exopolyphosphatase, putative  56.39 
 
 
310 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236338  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0609  Ppx/GppA phosphatase  58.12 
 
 
326 aa  301  8.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91513  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6144  Ppx/GppA phosphatase  57.19 
 
 
322 aa  301  9e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24540  Ppx/GppA phosphatase  54.25 
 
 
314 aa  297  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3352  Ppx/GppA phosphatase  52.61 
 
 
348 aa  279  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.446334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3147  Ppx/GppA phosphatase  53.59 
 
 
329 aa  280  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.75368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18070  Ppx/GppA phosphatase  49.51 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1920  exopolyphosphatase  46.25 
 
 
322 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3233  Ppx/GppA phosphatase  50.16 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5094  Ppx/GppA phosphatase  42.05 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27230  exopolyphosphatase  38.85 
 
 
316 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104101  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  33.99 
 
 
534 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  32.48 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  31.83 
 
 
570 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  32.7 
 
 
550 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 
545 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 
545 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  28.4 
 
 
521 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 
557 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  30.56 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  27.6 
 
 
553 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
307 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
502 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 
550 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  29.94 
 
 
513 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  28.08 
 
 
514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  27.1 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  27.13 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  27.54 
 
 
519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  28.31 
 
 
521 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  27.69 
 
 
311 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  26.69 
 
 
531 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.28 
 
 
513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.51 
 
 
544 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  26.69 
 
 
531 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  26.37 
 
 
531 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.51 
 
 
544 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  27.71 
 
 
519 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  31.49 
 
 
502 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  30.23 
 
 
539 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  27.15 
 
 
531 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 
501 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  28.06 
 
 
510 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  26.47 
 
 
311 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  23.93 
 
 
305 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  25.25 
 
 
311 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.06 
 
 
511 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.79 
 
 
532 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  28.06 
 
 
523 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  25.97 
 
 
312 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  25.96 
 
 
314 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  22.26 
 
 
510 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  27.99 
 
 
323 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  29.87 
 
 
310 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  30.55 
 
 
548 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.36 
 
 
513 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  23.93 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  25.79 
 
 
524 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  26.71 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  29.41 
 
 
505 aa  95.9  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  27.48 
 
 
501 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  26.69 
 
 
527 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  31.8 
 
 
501 aa  92.8  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  30.1 
 
 
524 aa  92.8  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  29.81 
 
 
545 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  31.31 
 
 
304 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  29.93 
 
 
500 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  26.63 
 
 
519 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  31.33 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  32 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  23.28 
 
 
301 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  29.93 
 
 
526 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  29.93 
 
 
500 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  34.6 
 
 
322 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  25.16 
 
 
512 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  25.15 
 
 
549 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
500 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.52 
 
 
524 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  25.99 
 
 
501 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.16 
 
 
512 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  25.16 
 
 
512 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  27.07 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>