101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1155 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1155  protein of unknown function DUF1234  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0144  hypothetical protein  34.24 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0823373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  34.09 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  36.26 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  35.6 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  35.6 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  33.69 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  35.79 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  33.86 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  34.76 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  28.49 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  28.35 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  35.6 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  27.68 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  28.25 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  28.25 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  31.61 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  34.22 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  27.68 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  30.81 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  29.83 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  30.51 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  28.57 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  34.44 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  31.89 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  33.7 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  30.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  31.89 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  33.7 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  32.78 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  28.49 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  27.32 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  25.81 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2340  hypothetical protein  29.95 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  29.73 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  29.71 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  32.78 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  28.41 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  28.25 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  30.68 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1884  hypothetical protein  17.32 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000253294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1918  hypothetical protein  17.32 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000031538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  28.25 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  31.91 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  28.02 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  27.17 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  28.16 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  28.25 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  27.01 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  28.89 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  26.97 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  27.53 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  28.19 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  30.68 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  29.44 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  33.67 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  27.93 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  33.67 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  25.14 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0881  hypothetical protein  35.53 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0687838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1025  hypothetical protein  35.53 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.438734  normal  0.0581754 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  32.03 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  30.6 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4675  protein of unknown function DUF1234  28.18 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  30.22 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  25.77 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3513  hypothetical protein  30.46 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160487  normal  0.0541294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0052  hypothetical protein  31.61 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  26.86 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  29.1 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  31.28 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  29.71 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  29.71 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  30.86 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  31.84 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  27.37 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2508  hypothetical protein  39.22 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217816  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1063  hypothetical protein  26.86 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  31.22 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  28.02 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  26.86 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  24.24 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  25.81 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  31.22 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  24.24 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  27.36 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  27.42 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>