137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1344 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  70.98 
 
 		 224 aa  314  8e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  71.88 
 
 		 224 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  55.5 
 
 		 221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  57.62 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  44.71 
 
 		 190 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  44.71 
 
 		 190 aa  151  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  42.78 
 
 		 190 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  46.84 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  46.24 
 
 		 170 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  41.67 
 
 		 180 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  44.12 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  40.5 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  41.85 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  46.56 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  46.07 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  49.69 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  41.99 
 
 		 184 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  42.29 
 
 		 192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  40.33 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  44.68 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  44.83 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  40.84 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  44.51 
 
 		 180 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  47.73 
 
 		 183 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  44.68 
 
 		 207 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  37.91 
 
 		 181 aa  131  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  43.96 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  40.22 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  44.15 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  40.88 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  45.09 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  39.78 
 
 		 188 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  40.76 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  39.78 
 
 		 234 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  38.71 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  39.78 
 
 		 189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  42.62 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  43.32 
 
 		 193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  43.09 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  43.98 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  44.89 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  42.25 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  42.55 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  42.55 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  44 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  39.79 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  41.15 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  44.81 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  41.71 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  42.78 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  41.38 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  39.13 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  42.78 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  44.89 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  39.56 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  43.33 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  44.81 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  39.57 
 
 		 193 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  39.36 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  42.05 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  42.39 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  43.68 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  34.08 
 
 		 189 aa  116  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  39.04 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  43.33 
 
 		 182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  43.33 
 
 		 182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  41.94 
 
 		 193 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  42.05 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  40.98 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  41.18 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  41.18 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  38.59 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  44.97 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  44.62 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  41.48 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  35 
 
 		 193 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  41.81 
 
 		 186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  37.02 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  41.44 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  39.79 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  39.89 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  39.43 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  37.43 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  41.11 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  39.13 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  40.64 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  36.79 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  39.57 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0052  hypothetical protein  36.46 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  38.97 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  42.05 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  38.97 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>