138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4591 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  75.74 
 
 
191 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  70.11 
 
 
193 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  73.21 
 
 
192 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  72.62 
 
 
185 aa  254  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  68.72 
 
 
205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  53.14 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  52.57 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  50.28 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  52.57 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  49.72 
 
 
180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  52.57 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  50.82 
 
 
193 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  47.75 
 
 
183 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  50.27 
 
 
193 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  47.49 
 
 
179 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  50.57 
 
 
183 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  50.28 
 
 
229 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  49.14 
 
 
193 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  49.43 
 
 
217 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  47.49 
 
 
180 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  49.14 
 
 
193 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  42.13 
 
 
180 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  50.86 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  50.57 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  42.2 
 
 
189 aa  151  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  46.29 
 
 
181 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0052  hypothetical protein  45.37 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  46.51 
 
 
186 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  43.02 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  50.28 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  45.98 
 
 
189 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  45.09 
 
 
186 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  43.93 
 
 
184 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  44.77 
 
 
184 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  50.29 
 
 
183 aa  141  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  45.36 
 
 
201 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  46.89 
 
 
183 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0197  hypothetical protein  46.59 
 
 
204 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  40.12 
 
 
188 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  46.2 
 
 
187 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  40.12 
 
 
188 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  40.12 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  44.57 
 
 
184 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  41.81 
 
 
182 aa  135  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  43.35 
 
 
182 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  49.72 
 
 
193 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  45.41 
 
 
187 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  46.82 
 
 
183 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  44.91 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  45.6 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  45.09 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  44.83 
 
 
182 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  47.4 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  47.4 
 
 
183 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  39.08 
 
 
181 aa  131  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  39.11 
 
 
189 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  46.24 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  46.24 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  45.18 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  41.8 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  42.05 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  43.89 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  42.31 
 
 
182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  39.63 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  43.33 
 
 
184 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  42.78 
 
 
182 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  42.78 
 
 
182 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  42.69 
 
 
201 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  41.62 
 
 
189 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  42.29 
 
 
221 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  41.24 
 
 
224 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  44 
 
 
222 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  41.38 
 
 
183 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  42.05 
 
 
187 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  39.55 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  41.95 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  36.93 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  38.46 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  37.87 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  40.33 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  41.52 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  39.77 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  39.08 
 
 
207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  41.45 
 
 
204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  33.53 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  39.46 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  36.47 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  44 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  39.46 
 
 
189 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  39.8 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  39.8 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  38.15 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  39.8 
 
 
198 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  39.8 
 
 
198 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  39.8 
 
 
198 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  38.51 
 
 
207 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  38.51 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>