138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2867 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  98.07 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  93.72 
 
 
207 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  93.24 
 
 
207 aa  387  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  93.24 
 
 
207 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  93.24 
 
 
207 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  93 
 
 
221 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  82.29 
 
 
200 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  81.63 
 
 
200 aa  324  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  85.19 
 
 
200 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  82.9 
 
 
209 aa  306  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  78.57 
 
 
212 aa  307  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  82.9 
 
 
209 aa  306  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  82.9 
 
 
209 aa  306  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  52.84 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  46.11 
 
 
224 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  44.32 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  42.95 
 
 
190 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  44.68 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  43.59 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  43.59 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  40.36 
 
 
170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  42.77 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  44.91 
 
 
204 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  121  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  41.03 
 
 
190 aa  121  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  35.71 
 
 
216 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  47.4 
 
 
219 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  37.02 
 
 
210 aa  118  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  38.6 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  42.69 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  35.2 
 
 
189 aa  116  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  38.64 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  38.01 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  38.55 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  38.55 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  38.51 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  36.05 
 
 
189 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  33.73 
 
 
182 aa  108  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  37.5 
 
 
180 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  38.24 
 
 
191 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  34.5 
 
 
205 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  38.67 
 
 
193 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  37.29 
 
 
183 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  38.67 
 
 
193 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  39.08 
 
 
213 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  34.29 
 
 
193 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  44.63 
 
 
193 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  37.65 
 
 
193 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  38.98 
 
 
193 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  37.14 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  34.55 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  35.93 
 
 
186 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  32.22 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  36.53 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  36.57 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  30.86 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  37.22 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  31.67 
 
 
188 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  31.67 
 
 
234 aa  95.5  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  38.64 
 
 
183 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  37.14 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  36.07 
 
 
187 aa  95.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  36.26 
 
 
183 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  32.53 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  32.34 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  36.32 
 
 
202 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  36.57 
 
 
184 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  33.13 
 
 
184 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  38.79 
 
 
181 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  35.43 
 
 
184 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  33.33 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  35.23 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  35.56 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1468  hypothetical protein  37.35 
 
 
181 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4675  protein of unknown function DUF1234  40.35 
 
 
180 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  33.71 
 
 
193 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  33.94 
 
 
177 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  35.59 
 
 
182 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  35.59 
 
 
182 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  38.18 
 
 
185 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  37.29 
 
 
202 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  36.72 
 
 
182 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  33.14 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  36.31 
 
 
183 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4263  hypothetical protein  36.69 
 
 
181 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4134  hypothetical protein  36.69 
 
 
181 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  31.71 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  34.32 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  35.43 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  34.81 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  36.31 
 
 
183 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  34.81 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  34.81 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  34.81 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  34.5 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>