141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4650 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  77.73 
 
 		 216 aa  329  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  41.28 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  37.57 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  35.36 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  37.02 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  37.02 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  38.04 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  36.72 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  34.78 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  33.85 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  33.53 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  34.1 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  34.87 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  31.18 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  34.04 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  32.24 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  32.24 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  36.31 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  36.21 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  31.12 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  32.96 
 
 		 182 aa  95.5  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  30.77 
 
 		 190 aa  95.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  31.49 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  32.6 
 
 		 186 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  33.52 
 
 		 184 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  30.94 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  31.38 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  31.79 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  36.21 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  31.84 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  29.59 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  32.97 
 
 		 181 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  31.49 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  35.26 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  30.62 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  32.64 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  30.98 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  29.03 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  30.98 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  30.98 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  30.98 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  30.98 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  31.72 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  29.83 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  30.11 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  31.02 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  32.42 
 
 		 183 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  29.59 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  30.06 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  32.07 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  32.07 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  31.16 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  32.09 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  29.59 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  32.42 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  28.72 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  29.95 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  31.52 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  32.42 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  34.44 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  29.31 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  33.14 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  34.68 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2813  hypothetical protein  31.77 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214851  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  32.37 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  33.72 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  26.9 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  29.31 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  33.92 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  31.79 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  30.64 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1734  hypothetical protein  31.75 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2670  hypothetical protein  31.35 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  31.21 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  29.35 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2340  hypothetical protein  29.38 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  32.2 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  32.37 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  30.17 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  30.68 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  33.53 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  27.66 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  30.11 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  30.27 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  30.99 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>