138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0758 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  69.44 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  69.44 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  58.24 
 
 		 204 aa  194  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  45.11 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  43.43 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  42.69 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  39.89 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  40.94 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  42.11 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  36.93 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  40.35 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  40.35 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  40.35 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  38.01 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  40.33 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  38.59 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  40.35 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  41.99 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  36.93 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  39.31 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  37.64 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  34.9 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  41.42 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  37.06 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  36.93 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  40 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  32.96 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  39.51 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  35.59 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  35.63 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  38.1 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  38.55 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  39.16 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  38.89 
 
 		 195 aa  98.2  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  39.16 
 
 		 234 aa  98.2  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  37.7 
 
 		 222 aa  97.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  40.22 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  37.37 
 
 		 229 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  36.26 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  37.16 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  36.07 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  40.12 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  39.66 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  36.21 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  35 
 
 		 184 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  35.8 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  37.22 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  38.15 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  34.86 
 
 		 190 aa  94.4  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  35.93 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  37.13 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  36.69 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  36.87 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  37.21 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  36.93 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  36.05 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  36.05 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  35.88 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  36.16 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  35.33 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  36.87 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  34.91 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  35.96 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  30.98 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  37.36 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  32.77 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  37.34 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  37.72 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  37.72 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  36.09 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  37.14 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  37.14 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  37.36 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  37.08 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  34.73 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  36.57 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  37.95 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  36.75 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  36.57 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  33.14 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  36.57 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0052  hypothetical protein  34.81 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  33.52 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  35.87 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2340  hypothetical protein  33.94 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  35.52 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4675  protein of unknown function DUF1234  39.43 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2670  hypothetical protein  36.79 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  30.39 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  33.89 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  29.59 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>