136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2404 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  49.2 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  48.39 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  48.42 
 
 		 190 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  46.84 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  43.02 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  43.58 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  40.3 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  42.13 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  37.11 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  42.69 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  40.64 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  42.51 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  37.78 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  40.24 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  36.52 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  36.52 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  39.66 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  39.39 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  40.86 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  38.92 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  35.96 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  36.81 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  36.47 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  37.3 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  39.41 
 
 		 207 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  39.41 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  34.3 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  39.39 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  37.36 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  38.8 
 
 		 221 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  39.41 
 
 		 200 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  35.56 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  39.16 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  37.71 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  39.29 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  34.27 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  39.75 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  42.69 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  43.21 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  32.58 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  39.76 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  35.56 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  36.65 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  36.65 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  39.88 
 
 		 183 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  35.84 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  42.07 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  39.88 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  36.72 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  41.01 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  41.01 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  36.72 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  31.66 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  32.02 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  33.14 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  42.13 
 
 		 183 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  31.28 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  39.89 
 
 		 202 aa  98.2  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  35.84 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  39.78 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  36 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  36.9 
 
 		 184 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  36 
 
 		 180 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  36.75 
 
 		 183 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  39.23 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  35.06 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  34.86 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  34.29 
 
 		 177 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  33.89 
 
 		 189 aa  94.7  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  36.07 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  35.06 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  37.02 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  38.51 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  33.73 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  36.07 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  36.99 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  36.99 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  34.52 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  36.2 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  36.26 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>