140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1311 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  86.17 
 
 
190 aa  343  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  75.81 
 
 
190 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  73.12 
 
 
195 aa  298  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  48.39 
 
 
201 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  41.92 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  42.35 
 
 
222 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  42.94 
 
 
224 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  44.23 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  38.83 
 
 
221 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  40.59 
 
 
219 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  44.23 
 
 
221 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  38.89 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  43.59 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  43.59 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  38.75 
 
 
170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  42.95 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  33.89 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  42.31 
 
 
207 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  35.59 
 
 
184 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  35.23 
 
 
184 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  41.67 
 
 
207 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  41.67 
 
 
207 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  36.69 
 
 
205 aa  121  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  35.5 
 
 
192 aa  121  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  34.29 
 
 
188 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  34.29 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  35.5 
 
 
185 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  40.38 
 
 
200 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  35.26 
 
 
193 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  36 
 
 
186 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  36.92 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  34.08 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  36.93 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  32.57 
 
 
182 aa  118  6e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  38.37 
 
 
183 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  38.95 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  36 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  38.95 
 
 
183 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  38.37 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  36.46 
 
 
182 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  33.15 
 
 
188 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  39.02 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  35.16 
 
 
193 aa  111  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  34.3 
 
 
191 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  36.46 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4844  hypothetical protein  38.46 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00035092  normal  0.0103539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  36.75 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  42.31 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  36.26 
 
 
182 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  33.91 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1589  hypothetical protein  38.69 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  36.22 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 
209 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  38.61 
 
 
209 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  38.61 
 
 
209 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1608  hypothetical protein  38.1 
 
 
191 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  32.39 
 
 
193 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  34.66 
 
 
193 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  33.14 
 
 
183 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  36.21 
 
 
193 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  32.39 
 
 
193 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  36.21 
 
 
193 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  38.04 
 
 
204 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  37.64 
 
 
194 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  34.86 
 
 
189 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  33.53 
 
 
180 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  31.82 
 
 
193 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  34.76 
 
 
229 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  30.11 
 
 
193 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  33.53 
 
 
180 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  101  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  31.82 
 
 
193 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  35.8 
 
 
183 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  34.3 
 
 
182 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  31.64 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  34.34 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  35 
 
 
201 aa  99  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7179  hypothetical protein  33.71 
 
 
194 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.618191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  36.81 
 
 
181 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  33.53 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  29.89 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  34.44 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  34.66 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  34.66 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  34.44 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  34.66 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  32.35 
 
 
177 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  31.64 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  34.83 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  34.83 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  36.2 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  31.82 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  34.71 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  38.79 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  38.79 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  30.56 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  35.84 
 
 
189 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>