136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1327 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  401  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  92.82 
 
 
187 aa  343  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  48.31 
 
 
191 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  48.31 
 
 
191 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  43.55 
 
 
213 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  43.68 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  47.7 
 
 
204 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  42.51 
 
 
182 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  46.96 
 
 
191 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  45.11 
 
 
194 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  46.07 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  46.95 
 
 
183 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  45.36 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  46.15 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  46.41 
 
 
217 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  45.78 
 
 
189 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  43.52 
 
 
229 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  41.82 
 
 
189 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  46.71 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  39.53 
 
 
181 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  45.73 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  46.11 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  43.9 
 
 
183 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  45.2 
 
 
180 aa  131  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  42.69 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  43.11 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  42.86 
 
 
188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  45.2 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  45.12 
 
 
183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  45.56 
 
 
193 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  46.11 
 
 
193 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  42.86 
 
 
234 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  43.86 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  44.38 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  44.77 
 
 
186 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  42.86 
 
 
188 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  41.62 
 
 
180 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  44.57 
 
 
221 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  44.31 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  47.34 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  42.94 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  43.43 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  40.8 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  44.85 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  45.51 
 
 
193 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  44.31 
 
 
193 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  42.86 
 
 
207 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  42.86 
 
 
207 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  43.58 
 
 
189 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  43.11 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  42.51 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  44.94 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  42.29 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  42.29 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  44.97 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  42.29 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0052  hypothetical protein  41.71 
 
 
211 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  41.67 
 
 
222 aa  117  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  43.96 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  41.82 
 
 
183 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  41.81 
 
 
181 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  40.57 
 
 
200 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  43.26 
 
 
221 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  45.51 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  43.71 
 
 
193 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  40 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  43.2 
 
 
187 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  39.9 
 
 
224 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  39.43 
 
 
200 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  43.27 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  40.54 
 
 
182 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  40.57 
 
 
200 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  37.43 
 
 
193 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  40.54 
 
 
182 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  39.77 
 
 
170 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  41.04 
 
 
183 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  40.36 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  40 
 
 
224 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  42.69 
 
 
201 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  42.94 
 
 
182 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  32.04 
 
 
183 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  39.55 
 
 
184 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
209 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  36.57 
 
 
183 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  34.21 
 
 
189 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  38.5 
 
 
182 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  38.98 
 
 
209 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  38.98 
 
 
209 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  40.22 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  37.14 
 
 
179 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  40.22 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  40.22 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  40.7 
 
 
183 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  40.22 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  40.22 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  39.23 
 
 
202 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  38.64 
 
 
182 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>