140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0442 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  100 
 
 
200 aa  407  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  93 
 
 
200 aa  367  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  79.9 
 
 
200 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  81.63 
 
 
207 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  81.12 
 
 
207 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  81.12 
 
 
207 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  81.63 
 
 
207 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  81.12 
 
 
207 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  79.59 
 
 
207 aa  322  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  80.41 
 
 
221 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  77.32 
 
 
212 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  79.27 
 
 
209 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  79.27 
 
 
209 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  79.27 
 
 
209 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  48.86 
 
 
233 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  43.89 
 
 
224 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  41.48 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  41.38 
 
 
222 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  39.74 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  40.23 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  40.38 
 
 
190 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  36.14 
 
 
170 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  40.38 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  35.36 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  33.52 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  36.47 
 
 
185 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  44.52 
 
 
219 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  39.1 
 
 
190 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  35.87 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  39.43 
 
 
201 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  39.41 
 
 
201 aa  111  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  36.47 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  38.29 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  37.93 
 
 
216 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  34.12 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  35.06 
 
 
180 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  34.43 
 
 
189 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  37.57 
 
 
193 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  37.57 
 
 
193 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  35.03 
 
 
180 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  39.08 
 
 
204 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  35.88 
 
 
191 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  35.03 
 
 
180 aa  104  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  34.41 
 
 
191 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  34.41 
 
 
191 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  37.93 
 
 
213 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  34.88 
 
 
189 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  37.06 
 
 
194 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  38.67 
 
 
203 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  101  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  31.11 
 
 
188 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  37.58 
 
 
193 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  36.09 
 
 
193 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  30.86 
 
 
181 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  33.94 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  34.43 
 
 
187 aa  99  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  37.3 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  36.97 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  36.97 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  31.74 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  32.73 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  34.55 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  30 
 
 
234 aa  95.9  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  38.07 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  32.12 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  35.08 
 
 
189 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  36.63 
 
 
182 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  36.63 
 
 
182 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  34.46 
 
 
183 aa  94.7  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  37.3 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  37.14 
 
 
184 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  36.36 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  35.75 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  32.37 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  36.16 
 
 
182 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  33.92 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  35.15 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  32.14 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  38.86 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  34.86 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  33.94 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  36.36 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  34.91 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  36.16 
 
 
182 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  36.16 
 
 
182 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  35.8 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  33.53 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  36.97 
 
 
181 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  31.79 
 
 
183 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  34.08 
 
 
198 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  34.08 
 
 
198 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  34.08 
 
 
198 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  34.08 
 
 
198 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  35.5 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>