136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3913 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  346  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  94.61 
 
 
185 aa  307  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2508  hypothetical protein  74.3 
 
 
185 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217816  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3513  hypothetical protein  73.33 
 
 
181 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160487  normal  0.0541294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1468  hypothetical protein  61.33 
 
 
181 aa  197  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4263  hypothetical protein  60.22 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4134  hypothetical protein  60.22 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  49.16 
 
 
183 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  49.72 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  46.89 
 
 
182 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  36 
 
 
189 aa  135  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4675  protein of unknown function DUF1234  51.4 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  46.37 
 
 
184 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  46.93 
 
 
182 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  46.37 
 
 
182 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  46.37 
 
 
182 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  46.11 
 
 
184 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  43.18 
 
 
189 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  47.46 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  41.11 
 
 
183 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  43.26 
 
 
187 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  44.44 
 
 
202 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  39.44 
 
 
183 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  36 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2340  hypothetical protein  40.8 
 
 
186 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  45.76 
 
 
182 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  45.76 
 
 
182 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  43.09 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  42.31 
 
 
183 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  37.93 
 
 
193 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  41.95 
 
 
216 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  34.08 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  31.87 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  36.67 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  39.44 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  40.23 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  44.63 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  41.34 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  38.98 
 
 
181 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  38.12 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  38.42 
 
 
191 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  38.24 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  41.04 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  37.22 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  38.15 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  41.04 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  37.22 
 
 
224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
182 aa  109  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  37.78 
 
 
193 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  36.67 
 
 
193 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  35.2 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  39.18 
 
 
193 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  35.75 
 
 
188 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  41.57 
 
 
183 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  39.43 
 
 
183 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  35.75 
 
 
234 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  37.22 
 
 
224 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  42.05 
 
 
229 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  40 
 
 
202 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  37.29 
 
 
190 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  39.2 
 
 
186 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  35.75 
 
 
186 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  38.32 
 
 
193 aa  104  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  37.78 
 
 
193 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  37.57 
 
 
184 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0197  hypothetical protein  40.46 
 
 
204 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  29.55 
 
 
182 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  35.56 
 
 
184 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  36.63 
 
 
205 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  36.78 
 
 
193 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  39.66 
 
 
182 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  35.2 
 
 
189 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  35.03 
 
 
190 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  36.67 
 
 
188 aa  101  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  40.94 
 
 
193 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  40.34 
 
 
222 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  37.85 
 
 
217 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  35.16 
 
 
190 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  40.56 
 
 
183 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  37.14 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  37.43 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  39.44 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  36.16 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  37.72 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  37.72 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  39.66 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  34.88 
 
 
170 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  34.88 
 
 
185 aa  94.4  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  38.33 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  34.46 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  37.36 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  37.64 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  37.65 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  35.48 
 
 
233 aa  91.3  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  36.47 
 
 
207 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  37.65 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  32.77 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  39.44 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  39.44 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  35.88 
 
 
200 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>