138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3733 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  100 
 
 		 182 aa  361  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  100 
 
 		 182 aa  361  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  56.5 
 
 		 183 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  53.22 
 
 		 180 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  55.62 
 
 		 229 aa  184  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  52.63 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  55.83 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  50.55 
 
 		 183 aa  180  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  52.27 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  53.29 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0197  hypothetical protein  52.98 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0052  hypothetical protein  50.57 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  50.29 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  52.07 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  42.05 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  46.29 
 
 		 188 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  50.29 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  46.29 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  45.14 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  45.93 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  46.2 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  45.35 
 
 		 193 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  45.93 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  44.77 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  49.7 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  46.29 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  48.54 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  45.2 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  49.14 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  43.64 
 
 		 189 aa  141  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  49.11 
 
 		 202 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  47.88 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  46.24 
 
 		 216 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  46.29 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  41.62 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  45.09 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  44.57 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  46.01 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  46.01 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  44.71 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  40.83 
 
 		 189 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  44.63 
 
 		 217 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  52.35 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  42.86 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  42.2 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  41.28 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  51.46 
 
 		 186 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  41.28 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  44.71 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  42.69 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  44.44 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  42.13 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  43.2 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  38.37 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  44.77 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  47.16 
 
 		 202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  46.37 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  42.78 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  47.27 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  47.27 
 
 		 181 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  40.59 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  37.93 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  41.67 
 
 		 198 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  40.44 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2340  hypothetical protein  40.85 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  40.76 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  39.89 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  37.79 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  40.56 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  41.85 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  40.33 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  39.43 
 
 		 221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  38.95 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  40.44 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  43.43 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  43.53 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2508  hypothetical protein  41.24 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217816  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  36.96 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  41.76 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  38.32 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  44.71 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  44.71 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  32.6 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  36.07 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1734  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3513  hypothetical protein  42.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160487  normal  0.0541294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  34.97 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  42.24 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  40.23 
 
 		 233 aa  99  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>