138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1443 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
198 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  99.49 
 
 
198 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  99.49 
 
 
198 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  99.49 
 
 
198 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  70.95 
 
 
189 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7179  hypothetical protein  72.11 
 
 
194 aa  248  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.618191 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4844  hypothetical protein  74.72 
 
 
191 aa  236  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00035092  normal  0.0103539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1589  hypothetical protein  70.79 
 
 
191 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1608  hypothetical protein  70 
 
 
191 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1734  hypothetical protein  66.67 
 
 
189 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155283  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2670  hypothetical protein  60.22 
 
 
191 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2813  hypothetical protein  60.87 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214851  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  53.3 
 
 
189 aa  190  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  52.75 
 
 
189 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  41.44 
 
 
180 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  37.29 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  36.81 
 
 
181 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  44.09 
 
 
187 aa  120  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  36.79 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  40.41 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  39.78 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  37.89 
 
 
234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  37.89 
 
 
188 aa  118  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  39.47 
 
 
184 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  37.37 
 
 
188 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  38.59 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  40.21 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  39.18 
 
 
189 aa  116  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  38.95 
 
 
184 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  41.44 
 
 
189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  40.1 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  41.05 
 
 
191 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0866  protein of unknown function DUF1234  43.32 
 
 
203 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  39.3 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  39.06 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  38.83 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  41.27 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  43.68 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  39.27 
 
 
205 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  38.54 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  39.18 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  39.78 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  39.46 
 
 
182 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  36.96 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  39.06 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  39.44 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  38.25 
 
 
170 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  39.39 
 
 
193 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  39.25 
 
 
180 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  38.62 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  41.67 
 
 
182 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  41.67 
 
 
182 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  39.15 
 
 
181 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  42.25 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  37.16 
 
 
182 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  32.6 
 
 
182 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  37.76 
 
 
229 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  38.1 
 
 
193 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  39.13 
 
 
222 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  38.8 
 
 
184 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  37.84 
 
 
213 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  40.78 
 
 
187 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  40.44 
 
 
183 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  44.44 
 
 
202 aa  104  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  40.44 
 
 
183 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  37.36 
 
 
185 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  41.44 
 
 
221 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  40.22 
 
 
201 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  39.58 
 
 
224 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  37.7 
 
 
193 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  38.25 
 
 
183 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  37.36 
 
 
182 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  38.54 
 
 
224 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  39.89 
 
 
182 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  37.23 
 
 
183 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  38.5 
 
 
180 aa  101  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  37.97 
 
 
179 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  34.81 
 
 
190 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  34.62 
 
 
190 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  36.41 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  36.99 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  34.44 
 
 
190 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  38.86 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  39.56 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  35.16 
 
 
182 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  35.16 
 
 
182 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  39.47 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  34.07 
 
 
195 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  37.43 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  37.02 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  37.02 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  31.52 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  32.22 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  37.02 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>