136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1468 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1468  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  361  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4263  hypothetical protein  96.13 
 
 		 181 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4134  hypothetical protein  96.13 
 
 		 181 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  64.67 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  62.87 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2508  hypothetical protein  61.93 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217816  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3513  hypothetical protein  60.56 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160487  normal  0.0541294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  46.24 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  48.84 
 
 		 177 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2340  hypothetical protein  43.35 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  43.5 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  36.93 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  38.07 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  37.08 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  35.36 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  40.45 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  44.44 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  45.51 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  44.44 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  40.57 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4675  protein of unknown function DUF1234  46.33 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  36.72 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  44.25 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  43.82 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  42.25 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  42.25 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  39.78 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  40.88 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  37.91 
 
 		 193 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  41.94 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  37.16 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  40.8 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  34.78 
 
 		 193 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  41.99 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  36.41 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  35.33 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  39.77 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  35.87 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  35.33 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  39.01 
 
 		 221 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  38.42 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  37.85 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  35.33 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  35.2 
 
 		 188 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  38.89 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  38.2 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  34.64 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  35.8 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  36.93 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  34.64 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  39.89 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  37.21 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  39.11 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  39.53 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  42.29 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  37.21 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  38.2 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  40.91 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  37.7 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  42.2 
 
 		 182 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  35.23 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  42.2 
 
 		 182 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  40.91 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  36.57 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  32.39 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  34.5 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0197  hypothetical protein  38.86 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  36.84 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  38.1 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  33.91 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  36.21 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  36.47 
 
 		 207 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  36.69 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  36.16 
 
 		 217 aa  91.7  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  36.69 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  38.86 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  33.52 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  38.15 
 
 		 229 aa  91.3  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  36.21 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  35.71 
 
 		 193 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  34.48 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  35.29 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  33.71 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  36.26 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  37.71 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  37.06 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  36.26 
 
 		 207 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  36.26 
 
 		 207 aa  88.6  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  33.33 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  35.09 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  34.48 
 
 		 170 aa  88.2  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  35.96 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  34.48 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  35.23 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  36.21 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  33.71 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  39.43 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  37.27 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>