141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3513 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3513  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  352  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160487  normal  0.0541294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2508  hypothetical protein  73.18 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217816  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  73.05 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  73.05 
 
 		 181 aa  240  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1468  hypothetical protein  60.56 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4263  hypothetical protein  58.89 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4134  hypothetical protein  58.89 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  51.15 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  48.59 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  39.88 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  46.33 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  42.6 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  37.71 
 
 		 180 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  34.25 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2340  hypothetical protein  42.05 
 
 		 186 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  44.13 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  44.13 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  43.43 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  44.13 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  44.13 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  45.3 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  40.34 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  43.58 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  44.38 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4675  protein of unknown function DUF1234  49.44 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  46.93 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  38.2 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  38.2 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  36.26 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  44.89 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  38.98 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  36.52 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  35.96 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  40.11 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  34.08 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  38.92 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  38.12 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  40.23 
 
 		 216 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  41.9 
 
 		 202 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  40.22 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  40.11 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  36.93 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  38.64 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  39.13 
 
 		 224 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  40.11 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  39.01 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  40.68 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  38.12 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  36.46 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  39.31 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  37.43 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  36.46 
 
 		 234 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  41.44 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  35.91 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  41.38 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  40.57 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  30.9 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  38.76 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  37.99 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0197  hypothetical protein  39.89 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  37.43 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  40.57 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  39.89 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  38.33 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  39.01 
 
 		 222 aa  101  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  36.67 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  40.11 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  34.09 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  39.08 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  42.86 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  36.26 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  39.11 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  38.42 
 
 		 229 aa  99.8  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  42.86 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  33.52 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  37.79 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  35.96 
 
 		 193 aa  98.2  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  38.86 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  35.47 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  41.99 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  32.22 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  36.63 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  37.78 
 
 		 183 aa  94.4  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  30.9 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  36.93 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  39.01 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  35.06 
 
 		 170 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  33.7 
 
 		 189 aa  90.9  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  33.92 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  36.87 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  35.43 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4844  hypothetical protein  37.84 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00035092  normal  0.0103539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  32.4 
 
 		 213 aa  87.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  29.78 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  40.11 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  40.11 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  32.96 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  35.26 
 
 		 207 aa  84.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  34.25 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  34.25 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>