131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0144 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0144  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0823373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1155  protein of unknown function DUF1234  33.33 
 
 
196 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  32.34 
 
 
216 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  30.95 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  31.55 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  32.93 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  31.58 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  31.58 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  30.72 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  29.34 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  30.41 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  27.33 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  27.33 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  29.07 
 
 
193 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  29.59 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  29.28 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  28.9 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  28.4 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  27.98 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  30.56 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  28.65 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  29.09 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  27.38 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  28.49 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  26.79 
 
 
207 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  28.33 
 
 
216 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  27.98 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  29.07 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  26.79 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  26.79 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  27.91 
 
 
193 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  26.63 
 
 
217 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  27.22 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  26.95 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  27.91 
 
 
193 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  26.04 
 
 
183 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  27.91 
 
 
193 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  25.6 
 
 
182 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  27.91 
 
 
193 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  26.79 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  26.19 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  26.19 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  26.52 
 
 
198 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  26.52 
 
 
198 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  26.52 
 
 
198 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 
198 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  26.52 
 
 
198 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  26.19 
 
 
207 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  29.24 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  26.38 
 
 
193 aa  58.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  27.06 
 
 
188 aa  58.2  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  25.44 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  25.44 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4455  protein of unknown function DUF1234  28.65 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.72275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  25.6 
 
 
221 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  25 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
212 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  26.74 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3607  hypothetical protein  26.79 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4675  protein of unknown function DUF1234  26.74 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3913  hypothetical protein  27.38 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.709395 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  26.26 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  24.12 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  24.12 
 
 
209 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  28.24 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  25.6 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  29.07 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  25.44 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4268  hypothetical protein  26.19 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  24.85 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  26.16 
 
 
188 aa  54.7  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  23.67 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  26.9 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0197  hypothetical protein  27.49 
 
 
204 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  27.22 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  24.85 
 
 
234 aa  54.3  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  23.39 
 
 
213 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  27.33 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  23.67 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  29.38 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  29.31 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3513  hypothetical protein  25.6 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160487  normal  0.0541294 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  27.06 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  24.26 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  25.29 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1847  hypothetical protein  25.67 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220085  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  27.49 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  27.75 
 
 
202 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  29.24 
 
 
180 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2508  hypothetical protein  26.95 
 
 
185 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217816  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  25.88 
 
 
182 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1407  hypothetical protein  25.88 
 
 
182 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  30.77 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  30.77 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  26.01 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  28.65 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  27.17 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>