23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1063 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1063  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0881  hypothetical protein  35.03 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0687838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1025  hypothetical protein  35.03 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.438734  normal  0.0581754 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0169  hypothetical protein  34.95 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1918  hypothetical protein  26.67 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000031538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1884  hypothetical protein  26.67 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000253294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1365  hypothetical protein  26.34 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37595  predicted protein  26.75 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000291095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  32.56 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0060  alpha/beta fold family hydrolase  22.98 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  32.56 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  31.98 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  31.43 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0555  esterase of the alpha/beta hydrolase fold-like protein  25.77 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336538 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38168  predicted protein  28.65 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.182497  hitchhiker  0.000445912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  25.65 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  27.65 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  24.61 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  27.65 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0400  Alpha/beta hydrolase  30.15 
 
 		 203 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  25.93 
 
 		 207 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  25.93 
 
 		 207 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>