52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0169 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0169  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1025  hypothetical protein  35.67 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.438734  normal  0.0581754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1063  hypothetical protein  34.95 
 
 		 204 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0881  hypothetical protein  35.67 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0687838 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1918  hypothetical protein  26.52 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000031538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1884  hypothetical protein  26.52 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000253294  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38168  predicted protein  26.75 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.182497  hitchhiker  0.000445912 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1365  hypothetical protein  25.57 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0239  hypothetical protein  28.39 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  27.97 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  24.46 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  25.35 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  25.64 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  28 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0735  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  23.08 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  25.68 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4650  hypothetical protein  24.29 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  27.97 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2340  hypothetical protein  27.82 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  26.06 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  27.21 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2316  hypothetical protein  27.64 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.664366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  25.52 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3416  hypothetical protein  24.26 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.175516  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  28.21 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  26 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  25.34 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3119  hypothetical protein  26.24 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.204784  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3849  hypothetical protein  26.24 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  26.47 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  24.66 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0570  esterase  27.21 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  24 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  30.4 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  26.43 
 
 		 207 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  24.14 
 
 		 193 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7179  hypothetical protein  22.22 
 
 		 194 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.618191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  23.65 
 
 		 233 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  23.97 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  24.19 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  26.35 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  23.33 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1443  hypothetical protein  24.8 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  23.97 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0144  hypothetical protein  21.67 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0823373  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3103  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1069  hypothetical protein  24.8 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1354  hypothetical protein  24.8 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2336  hypothetical protein  24.8 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  25.18 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0758  hypothetical protein  27.78 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.902939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>