56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0498 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0498    100 
 
 		 381 bp  755    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.147433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.19 
 
 		 903 bp  626  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  83.24 
 
 		 867 bp  230  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  83.48 
 
 		 879 bp  224  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04668  permease  85.12 
 
 		 720 bp  194  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  83.96 
 
 		 564 bp  190  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  81.93 
 
 		 867 bp  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  85.71 
 
 		 1737 bp  172  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.31 
 
 		 864 bp  170  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.26 
 
 		 888 bp  163  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  81.31 
 
 		 936 bp  161  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  81.31 
 
 		 867 bp  161  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  81.23 
 
 		 867 bp  153  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.29 
 
 		 864 bp  139  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.36 
 
 		 888 bp  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.36 
 
 		 888 bp  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.81 
 
 		 888 bp  133  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.87 
 
 		 879 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.31 
 
 		 888 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.73 
 
 		 867 bp  111  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  87.85 
 
 		 864 bp  109  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  81.5 
 
 		 942 bp  103  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  81.5 
 
 		 972 bp  103  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  81.5 
 
 		 942 bp  103  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  81.5 
 
 		 972 bp  103  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  79.57 
 
 		 879 bp  103  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.12 
 
 		 891 bp  103  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.61 
 
 		 879 bp  103  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.39 
 
 		 873 bp  103  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  81.5 
 
 		 972 bp  103  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  82.82 
 
 		 972 bp  101  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  80.07 
 
 		 879 bp  101  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  81.92 
 
 		 846 bp  97.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  86.24 
 
 		 870 bp  97.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.24 
 
 		 879 bp  97.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.38 
 
 		 870 bp  95.6  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  86.41 
 
 		 867 bp  93.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.03 
 
 		 864 bp  93.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.41 
 
 		 879 bp  93.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  85.32 
 
 		 885 bp  89.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.49 
 
 		 864 bp  83.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.778332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.19 
 
 		 867 bp  83.8  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.42 
 
 		 897 bp  79.8  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  83.06 
 
 		 897 bp  79.8  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.42 
 
 		 897 bp  79.8  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.62 
 
 		 927 bp  79.8  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.31 
 
 		 912 bp  75.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  84.31 
 
 		 912 bp  75.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4139    89.66 
 
 		 159 bp  67.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.67 
 
 		 813 bp  63.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.91 
 
 		 888 bp  56  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04669  ABC transporter permease  89.29 
 
 		 159 bp  56  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.25 
 
 		 867 bp  56  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.33 
 
 		 867 bp  52  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 1122 bp  50.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.225654  normal  0.146182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  100 
 
 		 909 bp  48.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>