48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4139 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4139    100 
 
 		 159 bp  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3153  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  98.63 
 
 		 912 bp  274  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.95 
 
 		 912 bp  266  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.451363  normal  0.0367857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.2 
 
 		 879 bp  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.11 
 
 		 870 bp  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.608365 
 
 
-
 
NC_003296  RS03033  transmembranee ABC transporter protein  87.5 
 
 		 897 bp  111  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.24 
 
 		 873 bp  107  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6691  putative ABC transporter  88.24 
 
 		 867 bp  107  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.74 
 
 		 927 bp  107  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.24 
 
 		 879 bp  107  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4139  sulfonate/nitrate ABC transporter permease  96.55 
 
 		 879 bp  99.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241741  normal  0.999839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4890  putative ABC transporter (permease protein)  91.89 
 
 		 846 bp  99.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2612 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.95 
 
 		 897 bp  85.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.95 
 
 		 897 bp  85.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  85.29 
 
 		 1737 bp  83.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  90.77 
 
 		 885 bp  81.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.23 
 
 		 888 bp  79.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.23 
 
 		 888 bp  79.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.23 
 
 		 888 bp  79.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.38 
 
 		 903 bp  75.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.563541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4966  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  91.38 
 
 		 564 bp  75.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0538  putative ABC transporter (permease protein)  91.23 
 
 		 864 bp  73.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1881  ABC transporter, permease protein  89.06 
 
 		 972 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0821  permease  89.06 
 
 		 942 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00555891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2036  permease  89.06 
 
 		 972 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1869  ABC transporter, permease protein  89.06 
 
 		 972 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0340  permease  89.06 
 
 		 942 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1684  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, permease protein  89.06 
 
 		 972 bp  71.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2172  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  89.83 
 
 		 879 bp  69.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.287546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5058  ABC transporter permease protein  86.49 
 
 		 870 bp  67.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.66 
 
 		 864 bp  67.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.97734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0498    89.66 
 
 		 381 bp  67.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.147433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34790  putative permease of ABC transporter  97.37 
 
 		 867 bp  67.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120138  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.88 
 
 		 867 bp  67.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.33 
 
 		 864 bp  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466577  normal  0.686195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04668  permease  83.51 
 
 		 720 bp  65.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0339  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  93.18 
 
 		 936 bp  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30900  ABC transporter, permease protein  90.38 
 
 		 867 bp  63.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5196  ABC transporter, permease protein  89.09 
 
 		 867 bp  61.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.89 
 
 		 888 bp  60  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.68 
 
 		 891 bp  58  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.46 
 
 		 888 bp  56  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.04 
 
 		 888 bp  52  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.21 
 
 		 867 bp  52  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.439861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.13 
 
 		 867 bp  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.82 
 
 		 813 bp  48.1  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0156  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  86.54 
 
 		 879 bp  48.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  93.55 
 
 		 1977 bp  46.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>