71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3381 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3381  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  266  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  62.79 
 
 		 510 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  45.88 
 
 		 385 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  47.13 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  47.13 
 
 		 512 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  45.98 
 
 		 513 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  45.12 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  43.02 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  50.59 
 
 		 513 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 513 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 513 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 513 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 513 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 513 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 513 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  44.83 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 519 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 519 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  43.21 
 
 		 519 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  44.19 
 
 		 523 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0180  ISPsy14, transposase  43.9 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  42.71 
 
 		 504 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 472 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3248  transposase  39.77 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 514 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 		 512 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1736  integrase, catalytic region  40.45 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  36.05 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  34.88 
 
 		 512 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  34.88 
 
 		 512 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  34.88 
 
 		 512 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  39.08 
 
 		 528 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 517 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 507 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2213  hypothetical protein  39.68 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.775376  unclonable  0.000000000124078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  47.54 
 
 		 487 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  36.78 
 
 		 513 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 		 514 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 		 514 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  41.79 
 
 		 539 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  34.48 
 
 		 513 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  35.29 
 
 		 514 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  41.79 
 
 		 510 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  41.79 
 
 		 510 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  41.79 
 
 		 510 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  41.79 
 
 		 510 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  40.7 
 
 		 525 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  36 
 
 		 517 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  36.36 
 
 		 517 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 514 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  37.66 
 
 		 507 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 514 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0081  transposase subunit  37.97 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  37.66 
 
 		 507 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  35.37 
 
 		 505 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4531  hypothetical protein  46.15 
 
 		 52 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  32.58 
 
 		 518 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  32.58 
 
 		 518 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  32.58 
 
 		 518 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  34.33 
 
 		 488 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0032  Aec51  44.07 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>