More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0714 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0714  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3494  two component transcriptional regulator  92.61 
 
 		 231 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0260421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.14 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  52.49 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  48.43 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  49.77 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  48.86 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  49.55 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  49.78 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  47.95 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  47.3 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  47.53 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  46.64 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 231 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  46.4 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  47.77 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  47.73 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  45.95 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  45.95 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  45.95 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  49.09 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  45.95 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  45.95 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  45.95 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  45.95 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.89 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  46.43 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 222 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  43.18 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.96 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.51 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.51 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04383  two-component system regulatory protein  43.44 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.51 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.51 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  46.61 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  46.61 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.61 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  46.15 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>