76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2152 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2152  hemerythrin-like, metal-binding  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  27.97 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  28.83 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  26.09 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  28.93 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  24.37 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  27.27 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  26.27 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  34.71 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  34.71 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  28.95 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  25.64 
 
 		 667 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.27 
 
 		 526 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  29.91 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.55 
 
 		 515 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.62 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  23.77 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  31.97 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  27.97 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  25.93 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 963 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  31.3 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  26.27 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  32.56 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  25 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  25.22 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.66 
 
 		 722 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  25.64 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 		 579 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  26.96 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  30.17 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  24.79 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  24.11 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  25.64 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.91 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 		 997 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.41 
 
 		 518 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.73 
 
 		 529 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.73 
 
 		 529 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.73 
 
 		 529 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.73 
 
 		 529 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  25.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.21 
 
 		 689 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 		 559 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  26.96 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  24.53 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  23.58 
 
 		 529 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.3 
 
 		 518 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  25.62 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  25.44 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  25.62 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  25.44 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 		 530 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.55 
 
 		 515 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4668  hemerythrin-like metal-binding protein  28.18 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334663  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.17 
 
 		 529 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.11 
 
 		 529 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.78 
 
 		 529 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  26.32 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  26.23 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  28.45 
 
 		 631 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  25.38 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  23.97 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  23.48 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  20.69 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  28.7 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3118  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.33 
 
 		 926 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  26.89 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  28.7 
 
 		 142 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>