More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2463 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2463  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
326 aa  657    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  31.52 
 
 
330 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 
369 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 
367 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 
330 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 
350 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  30.91 
 
 
330 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.23 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  30.28 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.98 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  32.84 
 
 
353 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.69 
 
 
341 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.22 
 
 
337 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0794  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 
332 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
348 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.59 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  28.95 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 
339 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  29.36 
 
 
336 aa  135  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.3 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.25 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  29.64 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  29.64 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 
344 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  31.94 
 
 
344 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.75 
 
 
347 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 
347 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 
342 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.21 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 
343 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.49 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0049  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 
337 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.79 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0159  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.169284 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  28.68 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  30.32 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  33.23 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.24 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 
335 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  30.36 
 
 
346 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.32 
 
 
336 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.88 
 
 
337 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  30.65 
 
 
339 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.12 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5674  LacI family transcription regulator  30.58 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  29.97 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.14 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  29.91 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.03 
 
 
341 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  29.03 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.03 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.03 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.03 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.03 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.03 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  29.03 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.67 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 
348 aa  129  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.02 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  27.27 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  32.04 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1025  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.43 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.96 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.31 
 
 
337 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 
338 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  29.64 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  29.17 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  29.64 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  29.64 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>