37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1836 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1836  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2121  hypothetical protein  99.48 
 
 		 213 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1754  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  96.39 
 
 		 194 aa  346  9e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3117  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  50.54 
 
 		 197 aa  177  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1434  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  50.54 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3599  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.83 
 
 		 226 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3449  sigma-24 (FecI-like)  47.83 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3531  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.83 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3557  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  46.96 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0683868  normal  0.0254908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2890  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.51 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2982  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.51 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0253387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2795  sigma-24 (FecI-like)  46.51 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0272  Fis family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341377  normal  0.75535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0920  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.57 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.776822  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0985  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.57 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664585  normal  0.0675077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2259  RNA polymerase sigma factor RpoE  29.03 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3144  sigma-24 (FecI-like)  28.66 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.283984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1596  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.64 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0424  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  24.46 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.582386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1055  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.96 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.607053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0297  RNA polymerase sigma factor  25.83 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240758 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1582  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3187  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.42 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0312752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2425  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.96 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0205284  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2848  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.29 
 
 		 392 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0536  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1796  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2786  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2808  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2473  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1723  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.29 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2901  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2906  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.01 
 
 		 199 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419523  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2396  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.65 
 
 		 164 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1078  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.01 
 
 		 199 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0834  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.43 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0132  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  21.85 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>