87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1434 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1434  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  100 
 
 		 193 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3449  sigma-24 (FecI-like)  55.38 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3531  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  55.38 
 
 		 190 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3599  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  55.38 
 
 		 226 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3557  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  51.89 
 
 		 189 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0683868  normal  0.0254908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1836  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  50.54 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3117  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  52.91 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2121  hypothetical protein  50 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1754  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  50.54 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2890  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  57.75 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2982  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  57.75 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0253387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2795  sigma-24 (FecI-like)  55.88 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3677  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.2 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4146  sigma-24 (FecI-like)  30.52 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0184  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.73 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1596  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.14 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0872  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  24.84 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.028729  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.49 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0424  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  27.86 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.582386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4775  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  20.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.253897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1194  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.87 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000462206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1261  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.87 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.782588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2095  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.32 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3390  RNA polymerase sigma factor  28.66 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00687646  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2022  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.82 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000162889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1320  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.91 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2019  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.71 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2934  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.55 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1130  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  21.71 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.938596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1348  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  21.71 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1195  RNA polymerase sigma-24 factor  23.6 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4469  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.67 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00981278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002491  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.41 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.012541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0719  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  22.45 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4136  RNA polymerase sigma factor  28.49 
 
 		 239 aa  44.7  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1195  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.97 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1272  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.97 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3118  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.97 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239779  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1239  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.97 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00674389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1031  RNA polymerase sigma factor RpoE  22.6 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000464646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03542  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.27 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0920  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.73 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.776822  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0985  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.73 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664585  normal  0.0675077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08291  RNA polymerase ECF-type sigma factor  25.29 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.929291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1153  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.97 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000609864  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1048  RNA polymerase sigma factor RpoE  22.6 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00110624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1055  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.18 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.607053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2838  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.54 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0903  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.34 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0974  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.98 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.082273  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0040  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.96 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1339  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.32 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2124  RNA polymerase sigma factor  29.71 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3352  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  33.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3423  RNA polymerase sigma factor  30.49 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1142  RNA polymerase sigma factor RpoE  22.6 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000720782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1159  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  21.71 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1471  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.97 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2259  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.18 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0856  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.81 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380767  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1000  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.81 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231343  normal  0.0259336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2045  RNA polymerase sigma factor RpoE  24.73 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2531  RNA polymerase sigma factor RpoE  23.76 
 
 		 192 aa  42  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0132  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.49 
 
 		 187 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2936  RNA polymerase sigma factor RpoE  24.86 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0097263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1092  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.76 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000530198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1433  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.735901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1085  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.67 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1342  RNA polymerase sigma factor RpoE  24.86 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3032  RNA polymerase sigma factor RpoE  24.86 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207774  normal  0.587259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4239  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.67 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1723  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.11 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3850  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.79 
 
 		 241 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.843877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0647  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.67 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2854  RNA polymerase sigma factor RpoE  24.86 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0729603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1127  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.67 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2786  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.11 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1796  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.11 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2808  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.11 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2473  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.11 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0536  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.11 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.543409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2901  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.11 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1237  RNA polymerase sigma factor RpoE  25 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000109114  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0834  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.56 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2177  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.56 
 
 		 199 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2125  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.5 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.726167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2251  RNA polymerase sigma factor AlgU  24.86 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015974  normal  0.140687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>