62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2795 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2795  sigma-24 (FecI-like)  100 
 
 		 188 aa  358  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2982  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  92.55 
 
 		 188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0253387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2890  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  92.55 
 
 		 188 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00371276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1434  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  56.15 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1836  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  46.74 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2121  hypothetical protein  46.2 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3117  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  47.51 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1754  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.37 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3449  sigma-24 (FecI-like)  45.55 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3599  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.55 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3531  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.55 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3557  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.09 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0683868  normal  0.0254908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1320  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.34 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0424  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  23.72 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.582386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4146  sigma-24 (FecI-like)  30.36 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.25 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0466  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.63 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2838  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.03 
 
 		 169 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3371  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.24 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0843  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.44 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1268  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.88 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00112474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3616  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.13 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154069  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5579  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.97 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7159  RNA polymerase sigma factor  32.03 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3098  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.85 
 
 		 157 aa  44.7  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002491  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.01 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.012541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1596  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.59 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6011  RNA polymerase sigma factor  32.68 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784268  normal  0.0725494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0605  RNA polymerase sigma factor RpoE  40.35 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000948588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3124  RNA polymerase, sigma-E factor  27.69 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00674158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4469  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.06 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00981278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1394  RNA polymerase sigma-E factor  27.98 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1115  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.98 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.37407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0040  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.68 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2045  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.62 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0719  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.17 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0184  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.96 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2569  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.79 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1261  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.95 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.782588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03542  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.28 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4685  RNA polymerase sigma factor SigM  34 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.501427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1194  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.95 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000462206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2320  RNA polymerase sigma-24 factor, putative  37.78 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.213027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0145  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.31 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3854  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.19 
 
 		 172 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08291  RNA polymerase ECF-type sigma factor  23.81 
 
 		 164 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.929291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0065  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.71 
 
 		 193 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1746  RNA polymerase sigma factor RpoE  24.82 
 
 		 200 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.30228  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4421  RNA polymerase sigma factor  23.7 
 
 		 188 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1237  RNA polymerase sigma factor RpoE  39.62 
 
 		 192 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000109114  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2934  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.06 
 
 		 180 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4485  RNA polymerase sigma factor  23.7 
 
 		 188 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0832298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.66 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212033  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2269  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.07 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2022  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.38 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000162889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1055  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.17 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.607053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2396  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.48 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4988  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.21 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.88444  normal  0.236889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0725  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  28.57 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2177  RNA polymerase sigma factor RpoE  29.07 
 
 		 199 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1339  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.78 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4167  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.04 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.209234  normal  0.395118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>