53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2432 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  879    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 
726 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  32.3 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  32.94 
 
 
414 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  32.22 
 
 
410 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  31.75 
 
 
414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  31.75 
 
 
414 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  31.75 
 
 
414 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  32.22 
 
 
410 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  31.67 
 
 
1033 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.17 
 
 
541 aa  179  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  31.01 
 
 
420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.85 
 
 
422 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.85 
 
 
422 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.27 
 
 
422 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.24 
 
 
424 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  27.73 
 
 
575 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.36 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  23.13 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  28.57 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  28.57 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.48 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.92 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23 
 
 
924 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  23.08 
 
 
891 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  22.85 
 
 
926 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  26.02 
 
 
402 aa  60.1  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  22.55 
 
 
904 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  22.55 
 
 
904 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  22.22 
 
 
912 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.53 
 
 
407 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  26.24 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  23 
 
 
894 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  22.85 
 
 
896 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.05 
 
 
418 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.5 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.93 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  20 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  26.9 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  23.02 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  21.76 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  26.85 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  22.88 
 
 
900 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  22.88 
 
 
914 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.88 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.16 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  31.82 
 
 
316 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.83 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  20.52 
 
 
424 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  23.51 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  27.89 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  24.32 
 
 
411 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  19.92 
 
 
756 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>