33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0196 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  666    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  31.61 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  29.86 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  29.54 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  35.9 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  28.94 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  32.66 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  31.09 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  31.91 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  31.44 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  29.8 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  32.68 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  26.71 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  32.03 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  32.03 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  32.92 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  32.92 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  30.54 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  31.6 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  32.08 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  31.1 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  31.1 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  30.38 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  50.94 
 
 		 199 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  27.72 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  25.37 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  28.07 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  26.7 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  27.46 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  26.97 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  21.88 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>