38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1634 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1641  hypothetical protein  95.43 
 
 		 700 aa  1400    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1634  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1474    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1636  hypothetical protein  44.29 
 
 		 705 aa  512  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1643  hypothetical protein  42.73 
 
 		 705 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  23.53 
 
 		 516 aa  96.3  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  23.29 
 
 		 516 aa  94.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  29.19 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  23.82 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 1126 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  29.74 
 
 		 1122 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  28.43 
 
 		 1122 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  25.4 
 
 		 463 aa  63.9  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  27.84 
 
 		 1124 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  27.39 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  25.81 
 
 		 420 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  27 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  26.8 
 
 		 1124 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  26.29 
 
 		 1124 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  26.34 
 
 		 434 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  25.93 
 
 		 426 aa  57  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  22.4 
 
 		 426 aa  55.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  21.47 
 
 		 478 aa  53.9  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  27.44 
 
 		 459 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  22.56 
 
 		 476 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  24.02 
 
 		 435 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  27.68 
 
 		 604 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  23.11 
 
 		 467 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  24.16 
 
 		 524 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  21.46 
 
 		 532 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  29.35 
 
 		 604 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  21.79 
 
 		 460 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  24.86 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  23.79 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  23.78 
 
 		 634 aa  45.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  29.35 
 
 		 589 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  24.66 
 
 		 1253 aa  45.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3716  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.89 
 
 		 636 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  20 
 
 		 715 aa  44.3  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>