40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0478 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0478  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0502  hypothetical protein  94.03 
 
 
203 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  41.71 
 
 
205 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5280  methyltransferase type 12  36.22 
 
 
207 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6048  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
217 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.724013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  30.35 
 
 
202 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000671  SAM-dependent methyltransferase  31.5 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190195  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06550  dimethyladenosine transferase  32 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11850  methyltransferase family protein  29.13 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0785893  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31140  methyltransferase family protein  28.49 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  32.35 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.69 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  24.12 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  26.38 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  25 
 
 
267 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  25 
 
 
267 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  23.31 
 
 
245 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  22.68 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  22.83 
 
 
246 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
303 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  28.32 
 
 
377 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  33 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  23.57 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  22.8 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  22.7 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  28.36 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  22.7 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  20 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  33.85 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  23.08 
 
 
218 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  30.14 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  26.09 
 
 
223 aa  42.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  32.69 
 
 
217 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  35 
 
 
280 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>