36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0008 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  100 
 
 		 321 aa  659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  50.31 
 
 		 323 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  49.07 
 
 		 323 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  49.07 
 
 		 323 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  48.46 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  48.8 
 
 		 322 aa  261  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  37.63 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  37.11 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  37.11 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  34.01 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  33.89 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  33.33 
 
 		 335 aa  92.4  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  25.7 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  30.27 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  27.23 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  31.22 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  28.99 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  28.39 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  30.69 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  30.94 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  30.99 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  30.69 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  29.63 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  29.61 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  27.65 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  27.37 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  28.7 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  27.18 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  31.91 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  27.03 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  30.93 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  26.82 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  26.63 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  24.16 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  28.17 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>