More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1910 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  99.38 
 
 
322 aa  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  99.7 
 
 
334 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  47.29 
 
 
325 aa  252  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.29 
 
 
336 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.19 
 
 
343 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  38.31 
 
 
317 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.11 
 
 
645 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.86 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.07 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.34 
 
 
324 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.56 
 
 
323 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.1 
 
 
420 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  32.48 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.11 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  34.36 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  30.15 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  30.96 
 
 
431 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.06 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  30.08 
 
 
333 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  35.46 
 
 
269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.98 
 
 
324 aa  109  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  30.77 
 
 
471 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.05 
 
 
412 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.17 
 
 
407 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.17 
 
 
407 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  31.2 
 
 
300 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.17 
 
 
407 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 
422 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2048  esterase/lipase  30.34 
 
 
297 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3874  hypothetical protein  30.07 
 
 
304 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.8 
 
 
409 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  32.24 
 
 
340 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.1 
 
 
308 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.5 
 
 
272 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30 
 
 
407 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.33 
 
 
322 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  31.28 
 
 
334 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.62 
 
 
1094 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  29.93 
 
 
337 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12506  carboxylesterase lipQ  36.05 
 
 
421 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329664  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  31.28 
 
 
334 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.97 
 
 
279 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  29.18 
 
 
414 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  29.18 
 
 
414 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  29.18 
 
 
414 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  28.26 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  28.17 
 
 
403 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  29.18 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.41 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  32.1 
 
 
314 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  30.22 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  29.86 
 
 
644 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  28.07 
 
 
311 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  33.49 
 
 
408 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  28.19 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.92 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  28.51 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  29.57 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  29.72 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  34.91 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1546  esterase/lipase  28.36 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0472354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  32.91 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  27.27 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  28.35 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.58 
 
 
360 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  34.51 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3173  acetyl esterase, putative  26.6 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.02 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  26.01 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  38.98 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  29.08 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.33 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.95 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  27.08 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3188  acetyl esterase, putative  26.07 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210653  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  33.33 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.15 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.98 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.98 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.48 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0293  esterase/lipase  24.63 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03310  esterase/lipase  28.5 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  26.88 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.57 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.57 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  38.14 
 
 
593 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  27.5 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  33.06 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.78 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5474  esterase/lipase  28.14 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2357  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.86 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00444827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  27.31 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.94 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  25.68 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  36.67 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  34.21 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.16 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  34.29 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.95 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>