More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1426 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1426  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
314 aa  638    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  99.04 
 
 
312 aa  627  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.53 
 
 
312 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0942  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.24 
 
 
316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.53 
 
 
328 aa  317  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.99 
 
 
321 aa  315  9e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.42 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.6 
 
 
336 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2409  aspartate carbamoyltransferase  51.76 
 
 
340 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.891458  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.28 
 
 
336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  50.81 
 
 
333 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.07 
 
 
334 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
320 aa  299  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.07 
 
 
334 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.11 
 
 
323 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
361 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
343 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
343 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
361 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
361 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.6 
 
 
343 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
361 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
361 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.75 
 
 
335 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.14 
 
 
334 aa  298  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  52.12 
 
 
334 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0246  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.59 
 
 
326 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.12 
 
 
334 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
334 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
334 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
334 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
334 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
334 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.12 
 
 
323 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
328 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
346 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.8 
 
 
341 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
317 aa  292  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2521  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.8 
 
 
343 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
341 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
343 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
343 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0385  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
343 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
343 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677096  hitchhiker  0.0028837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0867  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
343 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0267  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.64 
 
 
322 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3965  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.8 
 
 
381 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
327 aa  289  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
327 aa  289  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.8 
 
 
323 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
324 aa  289  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2481  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
316 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
320 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
320 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.8 
 
 
323 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
323 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.52 
 
 
317 aa  285  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.2 
 
 
320 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3345  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.87 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.87 
 
 
320 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4614  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
320 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.2 
 
 
320 aa  281  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.21 
 
 
319 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1380  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.44 
 
 
320 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.816603  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3698  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.88 
 
 
319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1829  aspartate carbamoyltransferase  45.54 
 
 
339 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.9 
 
 
362 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315008  hitchhiker  0.000272869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0531  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.39 
 
 
357 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0103229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
357 aa  269  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  47.99 
 
 
315 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  45.87 
 
 
311 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  49.17 
 
 
311 aa  256  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  48.68 
 
 
302 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  49.17 
 
 
313 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
323 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 
308 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1475  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.57 
 
 
310 aa  249  5e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
322 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
322 aa  248  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
322 aa  248  9e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.39 
 
 
308 aa  248  9e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.35 
 
 
328 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.56 
 
 
308 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.17 
 
 
316 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
315 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
315 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
317 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  47.1 
 
 
319 aa  246  4e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.02 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2195  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.52 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0591401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2221  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.52 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.17 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.84 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.68 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.35 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.35 
 
 
318 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  44.12 
 
 
305 aa  241  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>