212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0139 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  96.07 
 
 		 509 aa  894    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  100 
 
 		 509 aa  993    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  56.02 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 547 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  41.77 
 
 		 495 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  41.56 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  43.5 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  42.68 
 
 		 429 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  40.33 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  40.33 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  40.33 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  41.45 
 
 		 492 aa  294  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  39.4 
 
 		 491 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  39.4 
 
 		 491 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  39.4 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  39.4 
 
 		 491 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  39.4 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  39.4 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  39.4 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  39.4 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  39.4 
 
 		 491 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 		 416 aa  289  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  38.8 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  38.8 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  38.8 
 
 		 491 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  38.8 
 
 		 493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  38.8 
 
 		 493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  37.74 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 425 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 416 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  31.88 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 411 aa  213  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 454 aa  213  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  33.4 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  33.2 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 		 459 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  34.38 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  30.78 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  49.77 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  29.53 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  30.17 
 
 		 466 aa  176  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 475 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 463 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  50.53 
 
 		 419 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  49.73 
 
 		 489 aa  173  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  30.14 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  50.6 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 417 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  29.56 
 
 		 437 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  28.57 
 
 		 550 aa  166  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 465 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  51.6 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 471 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  43.69 
 
 		 491 aa  164  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  31.3 
 
 		 515 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  30.45 
 
 		 466 aa  163  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  31.3 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  30.46 
 
 		 516 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  30.17 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 468 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  27.2 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 553 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  31.39 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 478 aa  156  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 550 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  29.03 
 
 		 450 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  29.92 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  30.12 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  29.38 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 441 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  29 
 
 		 515 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  29.74 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  28.72 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 482 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  28.9 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  26.8 
 
 		 447 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>