153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_R0042 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  97.1 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  94.2 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  97.62 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  89.71 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  97.62 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0012  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  86.57 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0014  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0021  tRNA-OTHER  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0370611 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0027  tRNA-Asn  89.66 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0025  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.452257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt01  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000864029  hitchhiker  0.00000418087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000781489  hitchhiker  0.000000692381 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_778  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0075  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t048  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t049  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t052  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt02  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00232285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t081  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000129685  normal  0.647259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  83.58 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0030  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0098  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0099  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0100  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0101  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0102  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0088  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000246842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0089  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000235445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0090  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0099  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0074  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414669  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0075  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399431  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0076  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000334137  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0077  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  83.58 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  83.58 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0074  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000706993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0076  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000019522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0077  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000220166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0049  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0050  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000774224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0051  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0052  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000813258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0053  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000303697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0026  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.1113400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03600  tRNA-Asn  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0061  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000104416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0062  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000100655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0063  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0064  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0065  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000102168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0073  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000291565  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0076  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000573858  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0077  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000573858  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0078  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000554135  normal  0.120054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0079  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000264288  normal  0.119023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0080  tRNA-Asn  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000113933  normal  0.120667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>