16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0025 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0025  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.452257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0009  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0475152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0026  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.1113400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>