299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0052 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    91.55 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  87.67 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0052  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAsnVIMSS1309178  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAsnVIMSS1309137  tRNA-Asn  88.41 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.898434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0028  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0056  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.880886  decreased coverage  0.00985409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0031  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000643005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0067  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0075  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0046  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000652879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0047  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000113586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>