283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14020 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  92.75 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0048  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0049  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0762286 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0003  tRNA-Asn  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.401979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0038  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0005  tRNA-Asn  89.86 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.657067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0048  tRNA-Asn  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0033  tRNA-Asn  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0027  tRNA-Asn  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  86.57 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0021  tRNA-OTHER  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0370611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0017  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.808131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  97.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0018  tRNA-Asn  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000781489  hitchhiker  0.000000692381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000864029  hitchhiker  0.00000418087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0025  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0070  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt02  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00232285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0076  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.509004  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0071  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0401239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0073  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0422626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0069  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000102362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0071  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000229648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0072  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000849142  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0074  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0072  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0069  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0119  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0118  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000046805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0122  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0121  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0076  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000596623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0075  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000559002  normal  0.199391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0074  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000584221  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0080  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000390034  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0012  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0068  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0474424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0053  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0124  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t07  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t08  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t09  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t10  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0051  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000466422  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0052  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000553909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0053  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000495579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0054  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000490544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0120  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0123  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0075  tRNA-Asn  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000218117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0025  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000914395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0026  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0027  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0793414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00034  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0039  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000583297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0040  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000809411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0026  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0046  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733647  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0025  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.253153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1135  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155907  hitchhiker  0.0000576998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0024  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.131975  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0047  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044997  normal  0.297586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0700  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000146512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0045  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000379772  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0044  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000371151  hitchhiker  0.00258348 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0053  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100848  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0054  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020745  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0055  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0679012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>