27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2702 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2702  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
1305 aa  2586    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0513  hypothetical protein  49.14 
 
 
878 aa  361  6e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  60.78 
 
 
433 aa  57.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  50 
 
 
268 aa  57.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  23.92 
 
 
1748 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  46.97 
 
 
1281 aa  53.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  56 
 
 
430 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  24.24 
 
 
1154 aa  50.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.509455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 
628 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  56.82 
 
 
457 aa  49.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 
846 aa  49.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  59.09 
 
 
431 aa  48.9  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  40.19 
 
 
675 aa  48.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  63.83 
 
 
771 aa  48.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  45.45 
 
 
914 aa  48.5  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  56 
 
 
329 aa  48.5  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  57.41 
 
 
830 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  54.39 
 
 
338 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  65.85 
 
 
1034 aa  47.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  51.02 
 
 
489 aa  47  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5165  hypothetical protein  32.48 
 
 
570 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  52.08 
 
 
1409 aa  46.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  59.09 
 
 
253 aa  45.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
257 aa  45.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  40.54 
 
 
1050 aa  45.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.14 
 
 
445 aa  45.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  44.44 
 
 
667 aa  45.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>