30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07070 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  100 
 
 
1154 aa  2362    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.509455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1079  Alpha-glucuronidase  43.4 
 
 
726 aa  561  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1836  Alpha-glucuronidase  42.52 
 
 
709 aa  541  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4316  Alpha-glucuronidase  41.05 
 
 
730 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1025  ribosomal protein S18  43.07 
 
 
754 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000586584  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6197  Alpha-glucuronidase  40.32 
 
 
707 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03852  alpha-glucuronidase  44.9 
 
 
731 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1993  Alpha-glucuronidase  37.67 
 
 
717 aa  499  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0797  Alpha-glucuronidase  37.69 
 
 
710 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000695793  normal  0.131309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2706  Alpha-glucuronidase  37.83 
 
 
683 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0141  Glycosyl hydrolase 67 middle domain protein  34.32 
 
 
697 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0871  Alpha-glucuronidase  36.35 
 
 
688 aa  413  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0060  Alpha-glucuronidase  40.13 
 
 
690 aa  399  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0854  Alpha-glucuronidase  34.73 
 
 
693 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0891  Alpha-glucuronidase  35.09 
 
 
674 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09286  alpha-glucuronidase (Eurofung)  33.68 
 
 
847 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0490626  normal  0.152371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0869  Alpha-glucuronidase  34.8 
 
 
674 aa  365  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1714  Alpha-glucuronidase  35.49 
 
 
685 aa  365  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00270664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  33.7 
 
 
826 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3158  Alpha-glucuronidase  34.51 
 
 
684 aa  347  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1975  Alpha-glucuronidase  39.03 
 
 
650 aa  332  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2984  Alpha-glucuronidase  35.86 
 
 
677 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189953  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2394  Alpha-glucuronidase  35.6 
 
 
683 aa  328  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.278359  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3824  Alpha-glucuronidase  35 
 
 
695 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196614  normal  0.129894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0371  Alpha-glucuronidase  33.28 
 
 
679 aa  298  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33210  alpha-glucuronidase  34.08 
 
 
705 aa  296  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2388  fibronectin, type III domain-containing protein  28.8 
 
 
810 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.670329  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2702  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 
1305 aa  50.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  44 
 
 
1278 aa  50.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  34.38 
 
 
1729 aa  45.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>