51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0807 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0807  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 
160 aa  297  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  31.39 
 
 
274 aa  58.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  37.23 
 
 
242 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  37.88 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  37.69 
 
 
254 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  43.18 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  44.32 
 
 
255 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  32.81 
 
 
303 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  32.81 
 
 
303 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  32.81 
 
 
303 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.03 
 
 
303 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  32.82 
 
 
303 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  32.06 
 
 
303 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  33.83 
 
 
261 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  32.06 
 
 
303 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  33.58 
 
 
260 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  33.57 
 
 
275 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  37.58 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1719  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  34.19 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.68 
 
 
288 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  26.32 
 
 
300 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  29.87 
 
 
288 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  37.8 
 
 
253 aa  44.7  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  34.92 
 
 
225 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.41 
 
 
283 aa  44.3  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  35.05 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3012  peptidase A24A, prepilin type IV  35.44 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  28.69 
 
 
253 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  33.58 
 
 
281 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  33.58 
 
 
283 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  40 
 
 
263 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  28.87 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  28.67 
 
 
287 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  35.17 
 
 
296 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30 
 
 
280 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  37.5 
 
 
218 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  35.71 
 
 
181 aa  41.2  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  35.16 
 
 
242 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  41.77 
 
 
222 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  31.58 
 
 
283 aa  40.8  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0378  peptidase A24A prepilin type IV  32.03 
 
 
225 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.735955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0731  peptidase A24A, prepilin type IV  36.09 
 
 
159 aa  40.8  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03137  hypothetical protein  32.03 
 
 
225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3529  type 4 prepilin peptidase  32.03 
 
 
225 aa  40.8  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.645409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  28.36 
 
 
302 aa  40.8  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0378  peptidase A24A prepilin type IV  32.03 
 
 
225 aa  40.8  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03186  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  32.03 
 
 
225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  30.56 
 
 
248 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  24.31 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  26.88 
 
 
289 aa  40.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>