47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3768 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  45.19 
 
 		 127 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  35.29 
 
 		 147 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  41.51 
 
 		 147 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  37.84 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  38.46 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  33.33 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  37.5 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  37.27 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  38.74 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  35.58 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  37.96 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  34.91 
 
 		 126 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  36.28 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  36.7 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  36.94 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  36.94 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  34.86 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  34.86 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  36.19 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  34.95 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  33.98 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  34.91 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  31.2 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  34.23 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  32.46 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  32.43 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  35.92 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  31.19 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  33.01 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  31.68 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  30.25 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  30.83 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  31.68 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  28.45 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  33.64 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  29.03 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  32.71 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  29.59 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  29.36 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  32.11 
 
 		 116 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  39.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>