More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0660 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  247  3e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 123 aa  176  8e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  141  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  141  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2457  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2179  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.980549  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2194  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2142  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  54.78 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  137  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  137  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  59.82 
 
 		 121 aa  137  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  54.17 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  58.93 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  56.25 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  59.82 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  55.75 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  52.46 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  56.25 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  57.63 
 
 		 118 aa  133  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  54.1 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0395  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280669  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  52.68 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  55.36 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  52.68 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0836  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  52.68 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0403  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2303  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0732212  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  54.46 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0272  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0236994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0350  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  50.82 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>