159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4462 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  324  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  94.83 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  87.88 
 
 		 1083 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  77.78 
 
 		 101 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  94.64 
 
 		 814 aa  107  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  98.21 
 
 		 100 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  91.53 
 
 		 766 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  62.39 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.06 
 
 		 312 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  88.52 
 
 		 940 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  92.98 
 
 		 952 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  94.74 
 
 		 100 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  77.03 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  98.18 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  90 
 
 		 281 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  91.67 
 
 		 75 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  59.79 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  74.67 
 
 		 721 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  96.3 
 
 		 387 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  96.36 
 
 		 108 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  94.55 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  69.77 
 
 		 634 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  76.71 
 
 		 178 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  98.15 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  96.3 
 
 		 2200 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  94.55 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  65.56 
 
 		 297 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  59.43 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  80.88 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  92.73 
 
 		 383 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  80.28 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  75.32 
 
 		 260 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  88.14 
 
 		 256 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  94.44 
 
 		 311 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  92.73 
 
 		 95 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  92.73 
 
 		 382 aa  101  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  94.34 
 
 		 382 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  96.23 
 
 		 383 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  96.23 
 
 		 439 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  75.34 
 
 		 202 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  67.47 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  90.91 
 
 		 373 aa  98.6  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  87.5 
 
 		 113 aa  97.1  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  89.29 
 
 		 106 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  92.59 
 
 		 270 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  92.59 
 
 		 80 aa  96.3  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  90.57 
 
 		 358 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  87.5 
 
 		 93 aa  94.4  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0118  hypothetical protein  76.12 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.899916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  85.71 
 
 		 82 aa  91.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  85.45 
 
 		 107 aa  87.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4571  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.5 
 
 		 266 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  65.22 
 
 		 320 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.12 
 
 		 833 aa  82  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3942  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.59 
 
 		 258 aa  81.3  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3291  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.59 
 
 		 257 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.517493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  50.63 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.04 
 
 		 294 aa  71.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.95 
 
 		 241 aa  70.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.3 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3844  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.25 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.21 
 
 		 285 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.51 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.5 
 
 		 317 aa  67.8  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  39.51 
 
 		 292 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.74 
 
 		 264 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.68 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.68 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.47 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.06 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.98 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  39.47 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.58 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.75 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.18 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.24 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.51 
 
 		 455 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  40.51 
 
 		 455 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.51 
 
 		 455 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  40.51 
 
 		 455 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.51 
 
 		 468 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  40.51 
 
 		 455 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.03 
 
 		 345 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  39.24 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.74 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3040  hypothetical protein  65.96 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.119269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.24 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  43.42 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.74 
 
 		 346 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.74 
 
 		 346 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.78 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.02 
 
 		 336 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.74 
 
 		 342 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.47 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.06 
 
 		 358 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.37 
 
 		 330 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5083  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.97 
 
 		 260 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2411  hypothetical protein  39.67 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>