More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3083 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3083  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
395 aa  773    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.796124  normal  0.594065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2560  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  74.18 
 
 
396 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3049  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  72.09 
 
 
379 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4620  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  74.19 
 
 
393 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.609739  hitchhiker  0.00139206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0804  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  59.57 
 
 
389 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12350  L-lactate dehydrogenase/FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  58.06 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0378  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  54.96 
 
 
371 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0702  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  52.97 
 
 
369 aa  346  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0089  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  49.45 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.69 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0839  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  51.26 
 
 
361 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2274  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  46.85 
 
 
369 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1817  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.67 
 
 
349 aa  294  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.466899 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4676  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  52.38 
 
 
363 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00322368  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.81 
 
 
366 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0513  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  49.73 
 
 
365 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0367469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.68 
 
 
366 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0529  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  49.45 
 
 
375 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2463  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.48 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  0.44924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  44.88 
 
 
358 aa  269  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1462  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.76 
 
 
352 aa  262  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0238326  normal  0.034718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0229  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.09 
 
 
364 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2905  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.59 
 
 
431 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0496  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  45.48 
 
 
382 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150259  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1466  Lactate 2-monooxygenase  46.65 
 
 
396 aa  249  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2057  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  45.04 
 
 
370 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.2 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4034  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.5 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4107  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.09 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  0.256454 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  35.31 
 
 
500 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  38.82 
 
 
392 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2130  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.97 
 
 
343 aa  223  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.559248 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  36.89 
 
 
593 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0905  Lactate 2-monooxygenase  38.19 
 
 
388 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  38.8 
 
 
378 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.42 
 
 
381 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1737  L-lactate oxidase  35.2 
 
 
400 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  34.3 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.62 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.35 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1798  L-lactate oxidase  34.95 
 
 
400 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
386 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1734  L-lactate oxidase  34.89 
 
 
400 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613324  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.82 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2478  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.77 
 
 
368 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  35.94 
 
 
379 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.65 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  37.33 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  37.33 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04570  conserved hypothetical protein  36.39 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02080  hypothetical protein  35.89 
 
 
370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  37.2 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  36.41 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.84 
 
 
381 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1052  lactate 2-monooxygenase  38.32 
 
 
431 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.162523  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.64 
 
 
381 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  38.79 
 
 
379 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  34.99 
 
 
381 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  34.99 
 
 
381 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4136  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.9 
 
 
386 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.71733  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  39.31 
 
 
440 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  39.31 
 
 
440 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4523  Lactate 2-monooxygenase  35.77 
 
 
426 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  39.31 
 
 
412 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  35.85 
 
 
379 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  39.31 
 
 
412 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  39.31 
 
 
412 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  39.31 
 
 
412 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.97 
 
 
406 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  37.33 
 
 
396 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  39.05 
 
 
440 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08744  FMN dependent dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02720)  34.99 
 
 
403 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  37.07 
 
 
396 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  38.07 
 
 
381 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.68 
 
 
378 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  37.95 
 
 
388 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1074  Lactate 2-monooxygenase  39.95 
 
 
393 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  38.8 
 
 
381 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  37.07 
 
 
395 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  33.94 
 
 
390 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.6 
 
 
380 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  37.27 
 
 
384 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.38 
 
 
385 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  35.6 
 
 
383 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.75 
 
 
383 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.26 
 
 
381 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22568  glycolate oxidase  36.99 
 
 
381 aa  203  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.708918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>