More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0790 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1406  acetolactate synthase, large subunit  56.48 
 
 
563 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0875131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  78.37 
 
 
611 aa  926    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1020  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  76.02 
 
 
565 aa  881    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
564 aa  1152    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1253  putative acetolactate synthase large subunit  39.39 
 
 
595 aa  389  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713143  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5588  thiamine pyrophosphate protein central region  39.54 
 
 
583 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1037  acetolactate synthase, large subunit  37.97 
 
 
551 aa  368  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0844069  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4081  thiamine pyrophosphate protein central region  36.84 
 
 
583 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721438  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  36.04 
 
 
599 aa  327  3e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  35.74 
 
 
587 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2846  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.29 
 
 
574 aa  320  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  34.77 
 
 
587 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  34.66 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  34.77 
 
 
587 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.96 
 
 
557 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
566 aa  299  1e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.35 
 
 
542 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.06 
 
 
588 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.67 
 
 
569 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.88 
 
 
557 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  32.23 
 
 
567 aa  291  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3747  acetolactate synthase catalytic subunit  35.73 
 
 
581 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747171  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.87 
 
 
563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  33.52 
 
 
555 aa  290  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.65 
 
 
559 aa  289  8e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.64 
 
 
557 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  33.7 
 
 
542 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.7 
 
 
555 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.39 
 
 
552 aa  287  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.49 
 
 
552 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.51 
 
 
555 aa  283  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.58 
 
 
563 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.78 
 
 
563 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.48 
 
 
565 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.77 
 
 
636 aa  280  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.94 
 
 
556 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.05 
 
 
569 aa  280  5e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.94 
 
 
561 aa  280  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  33.63 
 
 
568 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.99 
 
 
568 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.07 
 
 
559 aa  278  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.21 
 
 
558 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.79 
 
 
535 aa  277  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.8 
 
 
582 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.81 
 
 
568 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.87 
 
 
561 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.14 
 
 
584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.64 
 
 
569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.76 
 
 
563 aa  274  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.08 
 
 
564 aa  274  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.5 
 
 
562 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.82 
 
 
566 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  33.64 
 
 
569 aa  273  6e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  32.58 
 
 
577 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.18 
 
 
581 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.03 
 
 
569 aa  272  9e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.79 
 
 
570 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.39 
 
 
572 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.79 
 
 
561 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.93 
 
 
612 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.17 
 
 
554 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.88 
 
 
602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.07 
 
 
553 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0336  acetolactate synthase catalytic subunit  36.52 
 
 
575 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.18 
 
 
581 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.39 
 
 
572 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.39 
 
 
572 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34 
 
 
619 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.62 
 
 
572 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.42 
 
 
568 aa  267  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.36 
 
 
566 aa  267  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.37 
 
 
558 aa  266  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2284  acetolactate synthase catalytic subunit  33.63 
 
 
575 aa  266  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.774039  hitchhiker  0.0072458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.7 
 
 
581 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.12 
 
 
554 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  32.3 
 
 
577 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.73 
 
 
573 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  31.68 
 
 
550 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  31.68 
 
 
550 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  32.62 
 
 
581 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.44 
 
 
572 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
556 aa  263  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.99 
 
 
580 aa  263  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.21 
 
 
573 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  30.77 
 
 
550 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.08 
 
 
573 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.07 
 
 
572 aa  262  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.36 
 
 
566 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.54 
 
 
572 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.99 
 
 
581 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.08 
 
 
572 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.14 
 
 
572 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.6 
 
 
566 aa  261  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  30.53 
 
 
572 aa  260  5.0000000000000005e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.68 
 
 
611 aa  260  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  31.46 
 
 
578 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.83 
 
 
587 aa  260  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.21 
 
 
619 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.14 
 
 
572 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.2 
 
 
572 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>