49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6307 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  100 
 
 		 161 aa  320  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  64.75 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  68.53 
 
 		 155 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  57.24 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  63.75 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  67.83 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  73.44 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  58.09 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  51.68 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  61.02 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  51.47 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  55.47 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  56.2 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  43.26 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  47.06 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  56 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  38.75 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  42.66 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  46.4 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  41.94 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  42.98 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  41.32 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  38.58 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  37.6 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  36.8 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  38.93 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  36.69 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  37.1 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  33.86 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  33.86 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  41.74 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  37.78 
 
 		 738 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  36.67 
 
 		 738 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.98 
 
 		 730 aa  51.2  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.98 
 
 		 752 aa  51.2  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  41.03 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0771  DoxX family protein  32.18 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.135412 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  32.82 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2821  hypothetical protein  32.93 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  30.37 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  39.74 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  39.74 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1725  DoxX  35.16 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  33.67 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  31.11 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  31.97 
 
 		 155 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  34.23 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  34.23 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>